Конан с друзьями идёт в новый Токийский аквариум. Там, под колесом обозрения, он замечает девушку с разноцветными глазами. Она не помнит ни своего имени, ни своего прошлого. Конан обещает помочь девушке и вернуть её воспоминания.

Токио — огромный мегаполис, погрязший в преступности и беспорядках. Для борьбы с этим беззаконием был создан специальный отряд гражданской безопасности, который в народе прозвали «восьмым». Однако в этом отряде работают практически неадекватные люди, которые привыкли делать все по-своему, не задумываясь о последствиях. Асами Кадзари — девятнадцатилетняя помощница инспектора, которая была переведена в «восьмой отряд» для оценки их деятельности и информировании о них руководству. Однако девушка преследует и личную цель — изменить неорганизованно работающий отряд к лучшему.

После окончания жестокой Мировой Войны в Японии наука сделала резкий скачок вверх и начала развиваться не по дням, а по часам, давая человечеству выбор продолжать жить и ослаблять страдания с помощью современной кибернетики. Все человечество связано с помощью системы умов и личностей, известных как «Призраки». Самой большой угрозой цивилизации являются кибер-террористы, которые способны украсть человеческие тела и память. Когда вирус под названием FIre-Starter заражает систему и начинает распространяться, происходит убийство премьер-министра Японии, совершенное таинственным киборгом. ] Мотоко Кусанаги и её элитную команду оперативников специального назначения призывают выследить источник заражения. Копаясь всё глубже и глубже в расследовании, они обнаруживают следы правительственной коррупции и подозрительного брокера, который может иметь к этому отношение. Когда цель может находиться где угодно и выглядеть как угодно, единственный выбор, который остаётся, — это доверять своему Призраку и надеяться, что Вы не заражены.

Синъити Кудо – известный сыщик, который многим японским преступникам испортил жизни, выведя их на чистую воду. Но и бандиты ему сильно насолили, они отравили детектива, из-за чего мужчина превратился в семилетнего мальчика. Он решил взять себе имя - Конан Эдогава и продолжить скрыто бороться с криминалом. Также Конан считает, что он сможет вернуть себя взрослый внешний вид, а пока он будет вести жизнь простого семилетнего мальчика. Но как отмечалось, в этой простой жизни будет место для невероятных расследований.

2116 год. Японское правительство начинает экспортировать автономных роботов-дронов с системой «Сивилла» в «проблемные» страны, и «Сивилла» распространяется по всему миру. В качестве эксперимента решается запустить «Сивиллу» в СЮВАС (Союз Юго-Восточных Азиатских Стран) — государство, истерзанное гражданской войной. Опыт оказался удачным, и благодаря новой системе прибрежный город Шамбала начинает благоденствовать в обстановке временного перемирия и безопасности. Однако затем СЮВАС посылает в Японию своих агентов с целью совершить теракт. Те успешно проникают сквозь охрану «Сивиллы» и наносят удар изнутри. Подозрение падает на конкретного человека. Ответственная за проведение расследования, офицер Аканэ Цунэмори отправляется в Шамбалу. Истинная справедливость восстановит свою чистоту на новой земле.

Еще одно дополнение к франшизе «Призрак в доспехах», рассказывающее о появлении Девятого отдела МВД Японии. Отдел занимается различного рода расследованиями, которые не под силу вести полиции. Мотоко Кусанаги — майор, в детстве перенесшая многочисленные операции по кибернетизации тела и ставшая полноценным киборгом — оказывается под командованием Дайсукэ Арамаки , чтобы расследовать дело о взрыве бомбы. Однако помимо нее, Арамаки привлек к делу еще одного подозрительного человека, ветерана и экс-рэйнджера, по чьей вине случилось множество различных кровавых конфликтов в Южной Америке — Бато , и детектива Тогуса . Это послужило началу формирования Девятого отдела. Вместе эта троица должна дать отпор всем террористам.

Шуичи Акай стал мишенью таинственного снайпера так же, как и Масуми Сэра . Токио в панике, жители боятся попасть под огонь снайпера, о котором ничего неизвестно. Почему под прицелом оказалась Сэра? Сможет ли Акай выжить в этой передряге? Джоди Старлинг и Субару Окия также втянуты в происходящее. ] Конана предстоит новая проверка: сможет ли он отыскать и арестовать преступника?

При трагических обстоятельствах узнав об истинной природе «Сивиллы», инспектор Аканэ Цунэмори принимает решение подчиниться системе, искренне веря, что в конце концов человечность и правопорядок смогут сосуществовать в гармонии. После дела Сёго Макисимы и исчезновения Синъи Когами суматоха в департаменте утихла, и город вернулся к прежней размеренно управляемой жизни. Инспектор Цунэмори теперь — член нового подразделения полиции, а преследование и задержание преступников для неё отныне привычное дело. Казалось бы, жизнь вернулась в свою колею, но Аканэ пока не подозревает, что скоро она столкнётся с настоящим чудовищем, которое сотрясёт Систему до самого её основания...

Перенесёмся в параллельный мир, где правительство Японии монополизировало железнодорожные перевозки. В этом мире простой школьник Наото Такаяма мечтает о приличной работе на железной дороге. Он получает стажировку в железнодорожной охране, которая полна странных ребят. Например, Аой Сакураи, которая ненавидит парней. Кроме всего прочего, в этом параллельном мире есть и те, кто недоволен отсутствием приватизации и стремится это исправить, например, такие, как «RJ». Во что выльется это противостояние?

Действие сериала разворачивается в Токио 2018 года. В этом мире помимо обычных людей существуют и такие, которые способны использовать магию. Но, как всем известно: «Большая сила — большая ответственность», и потому существует множество законов и ограничений на использование волшебства. Если же они нарушаются, в игру вступают «адвокаты». А наша юная героиня как раз одна из них.

Действие фильма происходит на современном корабле военно-морских сил обороны Японии “Эгида”. На борту судна было найдено тело военнослужащего без левой руки. Поступила информация о том, что опасный шпион “X” проник на корабль, тем самым угрожая безопасности всей страны. Но диверсант еще не догадывается, что вероятность успеха его операции крайне мала, ведь за дело берется прославленный детектив Конан(Conan Edogawa). Юный сыщик в силах распутать самый сложный заговор, спасти жизни дорогих ему людей и поймать виновных.

Освободившись от своих обязанностей с 501-ым секретным отделом, Мотоко Кусанаги теперь должна выполнять приказы Дайсукэ Арамаки . Кто-то взломал искусственный интеллект Логикомы и Бато начинает собирать команду. Он заручается поддержкой бывшего армейского офицера разведки Исикавы и специалиста по взрывчатке и подрывному делу Бомы . Кусанаги также стремится привлечь к этому расследованию снайпера Сайто и тайного агента Падзу . Девятый отдел разворачивает очередную операцию.

Сатирическая комедия, повествующая о буднях человека, именуемого как «лучший убийца Японии». Непревзойденный. Не оставляющий никаких следов. Его девиз: «Если у меня задание, я убью что угодно и кого угодно».

Профессор Агаса просит Конана Эдогаву посетить бейсбольную игру, в которой участвует Минаэ — единственная девушка в команде. Минаэ приходится нелегко, а тренер считает, что ей не хватает уверенности в себе. Направляясь на скамейку запасных, она спотыкается о бейсбольную биту, которую легендарный игрок Мацуи Хидэки когда-то воткнул в землю. Согласно легенде, любой игрок, который сможет достать биту из земли, приобретёт силу настоящего бейсболиста.

В результате сотрудничества с J-лигой профессиональных игроков Японии по футболу, Конан и его команда оказываются на огромном стадионе, где проходит матч между командами Токио и Осаки. Задача детективов - узнать, кто заложил бомбу замедленного действия на стадионе и предотвратить взрыв. И всё это нужно сделать до окончания матча!

Через неделю после поражения на школьном футбольном чемпионате команда Синъити находит в тренировочном зале список критических замечаний о навыках каждого члена команды. Синъити решает найти автора списка.

Это история о большом городе, пропитанном насквозь преступностью. Вся власть куплена мафией, а на улицах творится бардак и беззаконие. Но есть тот, кто не поддастся блеску золота и сладким речам злодеев! Он накажет их своей пламенной силой! Трепещите, враги правосудия! Ибо в этот город из глубин ада пришёл он — Адский Полицейский!

К 2112 году умелая и прогрессивная Япония смогла создать утопичную идеалистическую модель общества, считавшуюся философами древности недостижимой. Толчком к этому послужила замена устаревшего государственного аппарата многофункциональной системой под названием «Сивилла», на которую люди возложили ответственность за сохранение порядка и обеспечение безопасности в обществе. Введение безотказной системы с неограниченными правами способствовало снижению преступности почти до нуля. На основе данных «психопаспорта» — уникальной характеристики личности — система мгновенно определяет индивидуальный коэффициент преступности — вероятность, с которой человек может совершить преступление, указанная в числовом значении — и, если коэффициент превышает норму, беспристрастно судит его как потенциального преступника. С приходом «Сивиллы» нормализовался уровень спокойствия среди населения. Постепенно люди превратились в бесстрашную инертную массу, толпу, неспособную распознать преступление, совершаемое прямо у всех на глазах. Лишённая погрешностей система показала, что вовсе не лишена погрешностей. Её слабость, как ни странно, оказалась в людях, которых она защищает. Полностью избавиться от потенциальных преступников невозможно, и случаи насилия, хоть и редко, но будут происходить. Те, чей коэффициент преступности ненамного превышает норму, «Сивилла» отправляет на принудительное лечение, а тех, кто переступил черту безвозвратно — приговаривает к уничтожению. Поэтому система, способная только судить, нуждается в исполнителях — тех, кто готов раз за разом приводить приговор в исполнение без страха «запятнать» свой «психопаспорт», тех, кто почти переступил черту. Бюро Общественной Безопасности, куда поступает на службу молодая следователь Аканэ Цунэмори, располагает такими людьми — затравленными «псами», выученными охотиться на злобных «волков».

Диана приглашает Конана Эдогаву и его друзей посетить Лондон. После возвращения в Японию Аи Хаибару начинает разыскивать подозрительный мужчина в чёрном, а позже выясняется, что Ая выглядит точь-в-точь как известная киноактриса Грэйс Аихара.

История начинается с угроз против губернатора Токио. Вскоре, лишь с помощью умения Конана быстро мыслить и предсказывать любые смертельные исходы, удаётся предотвратить взрыв в туннеле метро. Конан получает информацию, что возможна связь преступника с деревней, которая была перенесена из-за строительства дамбы. И великому детективу приходится мчаться со всех ног, чтобы остановить преступника перед тем, как он осуществит следующую атаку.

Хэйджи и «детективная компания» приехали навестить Конана в Токио. Вернувшись из недавней поездки, друзья привезли с собой сувениры, но из-за большой схожести они оказались перепутаны. Великий детектив решает разгадать эту загадку и расспрашивает о том, что происходило по дороге в Токио.

Хэидзи Хаттори приглашает Конана Эдогаву в закусочную «Окономияки».

В этой совершенно новой истории, выпущенной только на DVD, Эдогава Конан вместе с молодыми детективами выходят против призрачного вора Каито Кида, который нацелился на драгоценный камень, выставляемый в отеле на острове, куда приехали отдохнуть наши герои

В этой OVA события происходят через 10 лет после оригинального сериала и представляют собой альтернативный сюжет, где Конан и Аи не принимали противоядие APTX 4869 и росли вместе со своими друзьями, прилагая при этом все усилия, чтобы оставаться детективами.

В Японии происходит ряд убийств. Возле тел всех погибших находят кость маджонга масти пин разного достоинства. Японская полиция подозревает, что это дело рук серийного убийцы и созывает инспекторов со всех префектур Японии для расследования. Кроме того, по специальному приглашению, к расследованию присоединяется и Когоро Мори. Конан узнаёт детали совещания полиции, а также то, что в этом деле, каким-то образом, замешана и «Чёрная организация». Позднее выясняется, что среди детективов есть шпион «Организации» под кодовым именем Айриш, которому известно о личности Конана. Сможет ли Конан раскрыть это преступление, а также защитить себя и своих близких от «Чёрной организации»?

12 июля 2008 года в пяти кинотеатрах Японии прошёл показ ремейка оригинального фильма под именем «Призрак в доспехах 2.0» Новая версия включала в себя новые вставки видеоряда, обновленную компьютерную графику и спецэффекты, а также переработанные и переозвученные звуковые эффекты в спецформате 6.1.